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想问问大家，海外有没有比较便宜的生物信息用的服务器租用呢？
最近看到一些公众号在推广生物信息服务器租用，一般共享几十核的 CPU 加上几百 G 的内存，一个月数百元，倒是符合一般生物信息的应用了。但是最坑的是网络，不管是 github ，docker 还是 wget 一些海外数据库，速度和乌龟爬一样，尤其像 nf-core 这样重度依赖网络的流程基本就被坑死。
于是进一步想到，海外有没有类似的面向生物信息的服务器（多核，大内存，上 T 的硬盘存储空间）租用的廉价方案呢？这样困扰就少了一大截了。
希望了解情况的朋友能分享一下。
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HTDit 2023-12-25 18:34:38 +08:00 via Android
海外杜甫，去 hostloc 看看
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opengps 2023-12-25 18:44:51 +08:00
不要带着具体行业属性，换个关键字去了解：把“生信”替换为“大数据”
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BanShe 2023-12-25 19:06:36 +08:00
hostloc
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dji38838c 2023-12-25 19:13:58 +08:00
国内搞科研就是又想省钱又想跟上时代
多花点钱，选择就太多了 |
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lemonda 2023-12-25 19:19:38 +08:00
Fiberstate
128G 独立服务器，才 50 美元一个月 |
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mason961125 2023-12-25 19:29:46 +08:00  1
建议首先考虑合规，生信的数据大概率受跨境数据监管规范约束。
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hertzry 2023-12-25 19:56:25 +08:00
Github 科学上网，docker 换源，wget 用 IDM 下载再上传。
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hanh1985 OP @mason961125 其实没有这个问题，现在人遗都不约束粪便或者血液的数据了。而且主要还是海外的下载回来。
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hanh1985 OP @lemonda 我这儿看 120G 的怎么要 150 美元一个月呢 ( https://fiberstate.com/dedicated-servers/)？不过已经是我看到的最接近的了。感谢！
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BanShe 2023-12-25 21:43:55 +08:00
@hanh1985 捡便宜可以看 https://lowendtalk.com
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mason961125 2023-12-25 21:50:02 +08:00
@hanh1985 感觉你这个情况应该不会满载？如果是类似于批处理跑完就结束的话，各大厂的云按量计费其实挺划算的。
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hanh1985 OP @mason961125 没有跑程序的时候不会满载。 但是一旦跑就需要多 CPU 和大内存。这种配置的机器以前云厂商不见得说有就有，不知道现在怎样了。要是跑的东西一多可能费用就蹭蹭蹭上来了。
当然现在的主要问题是网络，所以要是有台海外的机器会比较好。 |
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hanh1985 OP 简单做了一下功课，和大家分享一下。这个可能的范畴是高性能 CPU 或者游戏服务器的独立服务器。在 VPS 主机的网站里面找“独服”，可以看到不少相关的信息。
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chihiro2014 2023-12-25 22:27:53 +08:00
hetnzer ？这个便宜。我记得当年租的时候 150 块钱一个月，然后 4c8h 32G 内存 4tb hdd ，1G 带宽共享
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mason961125 2023-12-25 23:42:09 +08:00
@hanh1985 噢，我前面脑子抽了打错字了，我的意思是你应该不会持续跑满一个月吧，如果是间歇性的负载其实按量很划算。
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lemonda 2023-12-26 03:35:47 +08:00
@hanh1985
https://lowendtalk.com/discussion/190499/b-l-a-c-k-i-s-h-f-r-i-d-a-y-s-a-l-e-fiberstate-mega-sale-giveaways-kaboom 120 美元可以买到 7950x 了。 50 美元买到的 5700g 回帖可以内存翻倍。 |
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SuperXX 2023-12-26 07:38:04 +08:00 via iPhone
搞科研要？ 学校没有 HPC 吗？ 确实没有可以考虑 Google Cloud ， 也可以申请 Credits 用于科研，AWS 也有类似的项目
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sunamask 2023-12-26 08:53:17 +08:00
理论上 nf-core 只在第一次运行的时候，对 github 的一些域名有要求，比如 raw.githubusercontent.com ，而且一般是企业用户的 config 文件、测试数据啥的。
你可以排查一下，把所有这类情况单独修改到本地就 OK 了（下载测试数据/数据库 reference/config 到本地，修改 config 文件里测试数据的路径啥的），这类文件一般不会随着版本更新有改动。 |
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sunamask 2023-12-26 08:55:43 +08:00
或者你可以试用一下 nf tower ？ Community edition 不花钱。
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hanh1985 OP @SuperXX 自己搞点项目，实践一些简单的想法。老有医院或者外面的人找，也可以把这些资源盘活起来。不想去蹭单位的资源，免得麻烦。云的那套也弄过，补助几年前也搞过。配置好了，成本也不低，现在就是想搞台单独的服务器，替代家里的工作站来用。
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hanh1985 OP @sunamask nextflow 也提供 offline 的方式，这样我可以在支持外网的环境下下载好需要的组件，然后传到一台便宜的服务器上去。
nf-core 只是个例子，我使用 R 编程的时候，常常还碰到要安装个库，然后就是连接超时。最近恰好碰到原来的服务器硬盘坏了，需要迁移所有的镜像和环境（屋里原来还有软路由）。如果加一点点钱可以避免这些麻烦，可以节省大量的时间。 |
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ushio 2023-12-26 09:37:30 +08:00
要大内存和多核可以去看看 Hetzner ，几十欧到两三百欧都有很多选择，像云筏这样的生信云创业公司初期都是买 Hetzner 分割成 VPS 卖
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sunamask 2023-12-26 12:37:00 +08:00
@hanh1985 #29 第一次碰到技术栈这么贴近的同行，泪目。
R 的话可以用 TUNA+renv 来管理环境，也可以做成容器，我的 R dev 环境就是和 Rstudio server 一起放在容器里的。 我是想说网络问题都有解决方案的，可以具体问题具体分析。 |
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hanh1985 OP fiberstate 没货。我在 dedioutlet 上找了一台，2x E5-2680V2 (20 核 40 线程), 96GB 内存，240GB SSD + 1T HDD, 64 美元一个月。用国内的双币信用卡付的账单。网上评价说与国内的通讯速度慢，但是我主要是在上面搭流程，做开发和分析，下载海外网站的速度快就可以。先用着看看，以后有更合适的再换。
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lemonda 2023-12-26 17:20:43 +08:00
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SuperXX 2023-12-27 00:15:22 +08:00 via iPhone
@hanh1985 那我推荐自己撸台二手服务器吧， 可以看看 EBay 上的准系统，比如 T7920 双路直接插满吧
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SuperXX 2023-12-27 00:17:18 +08:00 via iPhone
T7920 准系统前不久看的价格是 349 ， 也可以去 Reddit 上看看 HardwareSwap 或者 Homelabsales
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sNullp 361 天前
t/1004783
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sNullp 361 天前
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Rollie 282 天前 via iPhone
需求量大吗 我可以提供
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